Learee naturali protette sono quelle zone che sono state proclamate protette e sono entrate a far parte del Registro delle risorse naturali protette, e riguardano sia l'area protetta che la fauna, la flora, i funghi protetti ed inoltre anche minerali e fossili protetti.
Learee protette vengono classificate e distinte in nove categorie:
- Le Riserve naturali integrali sono aree di terra e/o mare non modificata o parzialmente modificata ancora in condizioni naturali.
- I Parchi nazionali sono aree ampie, principalmente non modificate con vari ed eccezionali valori naturali.
- Le Riserve speciali aree di terra e/o mare di particolare importanza per la loro singolarità, rarità e rappresentanza.
- I Parchi naturali sono larghe aree naturali o parzialmente coltivate, di terra e/o mare con caratteristiche ecologiche di interesse nazionale ed internazionale.
- I Parchi regionali sono larghe aree naturali o parzialmente coltivate, di terra e/o mare con caratteristiche ecologiche di interesse internazionale, nazionale e regionale.
- I Monumenti naturali protteggono un componente singolo o un gruppo di elementi animati o innanimati della natura.
- I Paesaggi protetti sono aree naturali o coltivate di distinto valore estetico, ecologico, storico-culturale e spesso con un alto tasso di diversità biologica.
- I Parchi bosco sono zone naturali o di foresta piantumata con un valore paesaggistico considerevole, destinate al riposo e alla ricreazione.
- I Monumenti di architettura paesaggistica sono aree modellate artificialmente (parchi, orti botanici, arboreti, parchi cittadini, viali alberati).
Circa il 9% dell'area totale della Regione istirana è protetto, e Natura Histrica ne copre e protegge il 6%. Nell'area della Regione istriana oltre all' EP Natura Histrica operano e si occupano dell'amministrazione di varie aree protette ed altre risorse naturali protette, altre tre istituzioni pubbliche:
- EP Parco Nazionale Brijuni
- EP Parco naturale Učka
- EP Kamenjak
Lista delle aree amministrate dall'EP Natura Histrica:
| No. | Protection category | Name of protected area | City / Municipality |
| 1. | Riserva speciale di vegetazione boschiva | Kontija | San Lorenzo del Pesenatico |
| 2. | Riserva speciale di vegetazione boschiva | Motovunska šuma | Motovun, Oprtalj |
| 3. | Riserva speciale paleontologica | Datule-Barbariga | Valle |
| 4. | Riserva marina speciale | Limski zaljev | Rovigno, Canfanaro, Sv. Lovreč, Orsera |
| 5. | Riserva ornitologica speciale | Palud - Palù | Rovigno |
| 6. | Monumento naturale geologico | Kamenolom Fantazija - Cave di Monfiorenzo | Rovigno |
| 7. | Monumento naturale geomorfologico | Vela Draga | Lupoglav |
| 8. | Monumento naturale geomorfologico | Jama Baredine | Parenzo |
| 9. | Monumento naturale geomorfologico | Markova jama | Parenzo |
| 10. | Monumento naturale zoologico | Pinzinova jama | Parenzo |
| 11. | Monumenti di architettura paesaggistica | Čempres u Kašćergi | Pisino |
| 12. | Monumenti di architettura paesaggistica | Dva stabla glicinije u Labinu | Albona |
| 13. | Monumento naturale | Četiri stabla pinije u Karojbi | Caroiba |
| 14. | Monumenti di architettura paesaggistica | Skupina stabala oko crkvice Sv. Ane kraj Červara | Parenzo |
| 15. | Paesaggio protetto | Gračišće-Pićan | Gračišće, Pićan |
| 16. | Paesaggio protetto | Labin-Rabac-Prklog | Albona |
| 17. | Paesaggio protetto | Okolina Istarskih toplica | Portole |
| 18. | Paesaggio protetto | Rovinjski otoci i priobalno područje | Rovigno |
| 19. | Paesaggio protetto | Pazinski ponor | Pisino |
| 20. | Paesaggio protetto | Limski zaljev | Rovigno, Canfanaro, San Lorenzo, Orsera |
| 21. | Paesaggio protetto | Učka sjever | Lupogliano |
| 22. | Paesaggio protetto | Učka jug | Kršan |
| 23. | Parco bosco | Škaraba | Rovigno |
| 24. | Parco bosco | Šijana | Pola |
| 25. | Parco bosco | Zlatni rt - Punta Corrente | Rovigno |
| 26. | Parco bosco | Busoler | Pola |
| 27. | Monumenti di architettura paesaggistica | Park u Nedešćini | Santa Domenica |
| 28. | Monumenti di architettura paesaggistica | Drvored Čempresa na groblju u Rovinju | Rovigno |
